디지털 PCR | dPCR 기술

알아보기 – 디지털 PCR(Digital PCR, dPCR)

디지털 PCR의 힘 – 건초 더미에서 바늘 찾기

디지털 PCR(Digital PCR, dPCR)은 샘플을 여러 개의 개별 반응으로 분획하여 각 반응에 0개 또는 하나 이상의 표적 분자가 존재하도록 하는 기술입니다. 이 접근 방식을 사용하면, 건초 더미에서 바늘 찾기처럼 네거티브 백그라운드에서 하나의 포지티브를 놀라울 정도로 쉽게 찾아낼 수 있습니다. 이는 낮은 검출 한계로 인해 표준 real-time 정량 PCR(quantitative PCR, qPCR)을 실행하지 못했던 경우 한 가지 방법이 될 수 있습니다.

디지털 PCR의 가장 큰 특징은 핵산의 절대 정량화입니다. 파티셔닝 후, 각 반응은 end-point PCR 사이클링을 거치고 각 파티션에서 형광 신호의 존재(양성 반응) 또는 부재(음성 반응)를 분석합니다. 이 정보를 바탕으로 샘플에 존재하는 분자의 절대적인 수를 계산할 수 있습니다. qPCR과 달리 dPCR은 표준 곡선에 의존하지 않습니다. 덕분에 dPCR은 qPCR보다 검출 한계가 낮고 정밀도가 높습니다.

연구자들은 복제수 변이 분석, 유전자 발현 정량화, 희귀 표적 검출과 같은 민감한 응용 분야에 점점 디지털 PCR을 더 많이 사용하고 있습니다. 이 방법은 세포 및 유전자 치료 연구, 암 연구, 전염병 조사, 식품 검사 등 다양한 분야 발전에 도움을 주었습니다.

당사의 사명은 디지털 PCR 과정에서 겪는 어려움을 극복하는 데 필요한 지식과 도구를 제공하는 것입니다. 어쩌면 건초 더미에서 바늘 찾기도 말처럼 어려운 일은 아닐지 모릅니다.

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미세방울 디지털 PCR(droplet digital PCR, ddPCR) 대비 장점

위에서 강조한 장점 외에도 나노플레이트 기반의 QIAcuity Digital PCR System은 미세방울 디지털 PCR 기반 시스템에 비해 상당한 이점을 제공합니다.

전체 디지털 PCR 워크플로가 하나의 시스템에 통합되어 수작업 시간이 단축되고 확장성이 향상되어 훨씬 더 빨라졌습니다.

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참고 문헌

Huggett JF et al. (2013). The digital MIQE guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments. Clin Chem. 59(6):892-902.

dMIQE Group, Huggett JF. (2020). The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020. Clin Chem. 66(8):1012-1029.

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