digital PCR, dPCR, Nanoplate principle
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Découvrir – La PCR digitale (dPCR)

Le pouvoir de la PCR digitale – Trouver une aiguille dans une botte de foin

La PCR digitale (dPCR) est une technique dans laquelle les échantillons sont fractionnés dans plusieurs réactions individuelles, on obtient ainsi une ou plusieurs molécules cibles, ou même aucune, dans chaque réaction. Étonnamment, cette approche facilite la détection d’un seul positif parmi de très nombreux négatifs, le problème type de trouver une aiguille dans une botte de foin. C’est pour ce type de cas que la PCR quantitative (qPCR) en temps réel standard n’est pas une solution viable compte tenu de sa limite de détection plus faible.

La principale fonctionnalité de la PCR digitale est la quantification absolue des acides nucléiques. Après le fractionnement, les réactions sont soumises à un cycle de PCR en point final, ensuite les fractions sont analysées afin de détecter la présence (réaction positive) ou l’absence (réaction négative) d’un signal fluorescent. Sur la base de ces informations, il est possible de calculer le nombre absolu de molécules présentes dans l’échantillon. Contrairement à la qPCR, la dPCR ne se base pas sur des courbes d’étalonnage. Ainsi, la dPCR présente une limite de détection inférieure et une précision supérieure à la qPCR.

Les chercheurs utilisent de plus en plus le système de la PCR digitale pour des applications sensibles. Cette méthode a permis de faire évoluer entre autres la recherche sur la thérapie cellulaire et génique, la recherche sur le cancer, la surveillance des maladies infectieuses et l’analyse des produits alimentaires.

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Webinaire à l’honneur : à la poursuite des agents pathogènes : utilisation de la dPCR et du séquençage pour la surveillance microbienne

Vous vous demandez quelle plateforme de dPCR est la plus adaptée pour la détection microbienne ? Participez à notre webinaire organisé par des experts portant sur l’utilisation de la dPCR pour améliorer la détection et la surveillance microbiennes, et arrêtez de jouer à cache-cache avec les microbes.

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Technologie de dPCR sur nanoplaques

Dévoiler la magie du fonctionnement

Les méthodes de fractionnement des échantillons dans la PCR digitale incluent les puces microfluidiques, les puces à ADN, les disques microfluidiques centrifuges et des techniques de gouttelettes basées sur des émulsions huile/eau. Pour réinventer la familiarité et la simplicité d’utilisation tout en améliorant la résolution, nous avons développé ces nanoplaques microfluidiques pour bénéficier d’un fractionnement supérieur et de meilleures données pour la PCR digitale.

Unveiling the magic inside
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Pas de gouttelettes. Pas de cristaux. Pas de puces.

Les principaux avantages de la PCR digitale sur nanoplaques incluent notamment :

  • Les plaques familières, simples d’utilisation, sont faciles à pipetter, exactement comme dans la qPCR
  • Les fractions fixes empêchent les variations de taille et la coalescence
  • Les nanoplaques scellées empêchent la contamination entre les puits
  • Possibilité de lecture plus rapide grâce à la mesure simultanée de toutes les fractions d’un même échantillon
  • Contrôle qualité intégré, on peut ainsi voir l’image de la plaque pour des signaux de fluorescence individuels issus des numérations de fractions positives individuelles
  • Les plaques sont adaptées à l’automatisation frontale

Avantages par rapport à la PCR digitale en gouttelettes (ddPCR)

En plus des avantages mis en évidence ci-avant, le QIAcuity Digital PCR System sur nanoplaques offre des avantages notables par rapport aux systèmes basés sur la PCR digitale en gouttelettes.

L’ensemble du flux de travail de la PCR digitale est intégré dans un seul système, le rendant considérablement plus rapide, réduisant la durée de manipulation et renforçant l’évolutivité.

En savoir plus sur la dPCR par rapport à la ddPCR

dPCR_workflow_comparison

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FAQ sur QIAcuity Nanoplate Digital PCR

Références

Huggett JF et al. (2013). The digital MIQE guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments. Clin Chem. 59(6):892-902.

dMIQE Group, Huggett JF. (2020). The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020. Clin Chem. 66(8):1012-1029.

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