Obtenga información sobre los mecanismos epigenéticos en muestras difíciles

La secuenciación de ADN es mucho más que eso

La secuenciación genética por sí misma no representa por completo la expresión genética ni la función celular. Los mecanismos epigenéticos, como la metilación del ADN, pueden influir en la actividad genética sin cambiar la secuencia de ADN. La metilación del ADN es una modificación estable, heredable y covalente del ADN, que se da principalmente en los CpG dinucleótidos aunque también se encuentra en los sitios que no corresponden a CpG. La metilación está asociada con un proceso de desarrollo normal, así como con los cambios que se pueden observar durante la oncogénesis y otros procesos patológicos, como la silenciación del gen supresor de tumores o los genes de reparación del ADN. Analizar el grado de metilación del ADN puede suponer todo un reto en muestras de biopsia líquida y FFPE, lo que aumenta la necesidad de una solución sólida y fiable que funcione con muestras de baja cantidad. Las soluciones Sample to Insight de QIAGEN para aplicaciones genéticas tratan de superar este reto y proporcionar unos datos fiables y útiles.

¿Sabe distinguir entre una variante real y un falso positivo?

Cada molécula de ADN tratada con bisulfito está marcada con un índice molecular único (UMI) previamente a la amplificación. Durante los análisis, los PCR duplicados y los falsos positivos se eliminan para proporcionar un perfil de metilación preciso.

¿Considera que es capaz de cubrir todas las regiones, incluso aquellas con alto contenido de GC?

Las tecnologías de expansión del cebador único utilizan solo un cebador específico y un cebador universal en cada amplicón, en comparación con la metodología tradicional, que utiliza 2 cebadores.

¿Qué ventajas ofrece esta metodología?

• Riesgo más bajo de dímeros de cebadores y abandonos
• Mayor uniformidad
• Mayor complejidad de la genoteca
• Solo se requiere un grupo de cebadores

¿Está pensando en ampliar el contenido de su panel dirigido? La tecnología de SPE no requiere un rediseño del cebador.

Del gDNA a la información del metiloma en un tubo y un día

• No desperdicie muestras valiosas: Al requerirse solo un volumen reducido de muestra, se pueden utilizar incluso muestras muy limitadas
• Ahorre tiempo: Obtenga una genoteca de NGS a partir del ADN genómico en un solo día mediante el protocolo de un único tubo
• Consiga resultados fiables: Se aplica un tratamiento de bisulfitos uniforme y altamente específico para convertir las citosinas no metiladas en uracilo
• Aplique análisis de datos integrados: Flujos de trabajo de bioinformática prefabricados y personalizables para cada investigador

Explore nuestros QIAseq Targeted Methyl Panels y Custom Panels.

Nuestros paneles compatibles con Illumina incluyen lo siguiente:

• Human Breast Cancer Panel
• Human Colorectal Cancer Panel
• Immuno-Oncology Panel
• Human T-cell Infiltration Panel

Automatice al máximo los procesos de pirosecuenciación

La pirosecuenciación integra la detección y la cuantificación de secuencias, y desempeña un papel fundamental en las aplicaciones de investigación que trabajan con la metilación de ADN epigenética en la regulación de expresiones genéticas. Descubra un protocolo automatizado y fácil de usar que permite preparar muestras de ADN monocatenarias y no requiere ningún tipo de intervención por parte del usuario.