Enthüllen Sie epigenetische Mechanismen bei anspruchsvollen Proben

Es geht um mehr als nur die DNA-Sequenz

Die genetische Sequenz allein entspricht nicht dem Gesamtbild der Genexpression oder zellulären Funktion. Epigenetische Mechanismen einschließlich der DNA-Methylierung können die Genaktivität beeinflussen, ohne die DNA-Sequenz zu verändern. Bei der DNA-Methylierung handelt es sich um eine stabile, vererbbare, kovalente Modifikation der DNA, die hauptsächlich im Bereich von CpG-Dinukleotiden auftritt, aber auch in Nicht-CpG-Bereichen beobachtet wird. Die Methylierung ist sowohl mit normalen Entwicklungsprozessen verbunden als auch mit den Veränderungen, die bei der Onkogenese und anderen pathologischen Prozessen wie dem Gen-Silencing von Tumorsuppressor- oder DNA-Reparaturgenen beobachtet werden können. Die Untersuchung des Grades der DNA-Methylierung kann bei FFPE- und Flüssigbiopsie-Proben eine Herausforderung darstellen, was den Bedarf an robusten, zuverlässigen Lösungen für Proben mit geringen Eingabemengen noch betont. Die Sample to Insight Lösungen von QIAGEN für epigenetische Anwendungen geht diese Herausforderungen an, um zuverlässige Daten und aussagekräftige Erkenntnisse zu ermöglichen.

Sehen Sie eine echte Variante oder ein falsch positives Ergebnis?

Jedes Bisulfit-behandelte DNA-Molekül wird vor der Amplifikation mit einem Unique Molecular Index (UMI) markiert. Im Rahmen der Analyse werden PCR-Duplikate und falsch Positive entfernt, um ein präzises Methylierungsprofil zu erhalten.

Können Sie alle Regionen abdecken – selbst solche mit hohem GC-Gehalt?

Die Single Primer Extension (SPE) Technologie verwendet anders als der traditionelle 2-Primer-Ansatz für jedes Amplifikat nur einen spezifischen und einen universellen Primer.

Das bedeutet:

• Geringeres Risiko für Primer-Dimere und -Dropouts
• Höhere Einheitlichkeit
• Höhere Library Komplexität
• Nur ein einziger Primer-Pool ist erforderlich

Sie möchten den Inhalt Ihres gezielten Panels erweitern? SPE erfordert keine Primer-Neugestaltung!

Mit einem Röhrchen und an einem Tag von der gDNA zu Einblicken in das Methylom

• Spart wertvolle Probe: Der geringe Eingabevolumenbedarf spart limitierte Proben
• Spart Zeit: Von der genomischen DNA zur NGS-Library in nur einem Tag mit dem Ein-Röhrchen-Protokoll
• Zuverlässige Ergebnisse: Hochspezifische und einheitliche Bisulfit-Behandlung zur Umsetzung nicht methylierter Cytosine in Uracil
• Integrierte Datenanalyse: Vorgefertigte und kundenspezifisch anpassbare Bioinformatik-Workflows für jeden Forscher

Entdecken Sie unsere QIAseq Targeted Methyl und Custom Panels.

Zu unseren Illumina-kompatiblen Panels zählen:

• Human Breast Cancer Panel
• Human Colorectal Cancer Panel
• Immuno-Oncology Panel
• Human T-cell Infiltration Panel

Automatisieren Sie Ihre Pyrosequenzierung vollständig

Pyrosequenzierung integriert Sequenzdetektion und -quantifizierung und spielt eine zentrale Rolle bei Forschungsanwendungen, die sich mit der epigenetischen DNA-Methylierung zur Regulierung der Genexpression beschäftigen. Lernen Sie ein benutzerfreundliches, automatisiertes Protokoll kennen, das einzelsträngige DNA-Proben ohne manuelles Eingreifen des Benutzers erstellt.