REPLI-g FFPE Kit

直接对福尔马林固定、石蜡包埋组织(FFPE)中的DNA进行全基因组扩增

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REPLI-g FFPE Kit (25)

目录编号 / ID.   150243

DNA Polymerase, Buffers, and Reagents for 25 x 50 μl whole genome amplification reactions
US$860.00
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Kit
REPLI-g FFPE Kit (25)
REPLI-g FFPE Kit (100)
REPLI-g FFPE Kit 旨在用于分子生物学应用。该产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。

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特点

  • 直接从石蜡切片中进行全基因组扩增
  • 对FFPE组织中的DNA进行全基因组扩增
  • 可扩展的标准化DNA产量:每个组织切片可达40 µg
  • 简单快速的操作,快速获取结果

产品详情

如果基因组DNA量不足以进行基因组分析,这一问题可通过对样本内全基因组DNA扩增解决。REPLI-g FFPE Kit包含DNA聚合酶、新型缓冲液和试剂,确保对福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织进行高效的全基因组扩增,无需预先纯化DNA。组织切片裂解后,对DNA进行处理后进行DNA片段连接,然后使用REPLI-g技术扩增长链DNA。

绩效

提供两种实验方案,扩增时间不同。标准2小时扩增反应方案,每50 µl反应体系的常规产量为10 µg,高产量反应(8小时扩增)可得到40 µg产物。

原理

用于基因分型研究的基因组DNA量通常不足。全基因组扩增(WGA)通过在样本内扩增全基因组,克服了这个难题,可扩增获得足量的来源于同一样本的DNA用于后续分析。

对福尔马林固定、石蜡包埋的组织样本(FFPE)进行基因分型,可将组织的形态变化直接与特定基因组变异联系起来。但是,福尔马林固定会导致DNA片段化,并与样本内的其他生物分子发生交联。此外,从FFPE样本中纯化得到的DNA量较少,只能用于少数几个分析。

REPLI-g FFPE Kit利用新型的DNA处理技术,将DNA片段连接起来(参见" REPLI-g FFPE principle")。然后通过经验证的REPLI-g技术对随机连接起来的DNA进行全基因组扩增。REPLI-g产品应与MDA以及独特的DNA聚合酶结合使用。REPLI-g DNA Polymerase凭借其活跃的进行性酶反应和单链置换反应,可很大程度上减少序列偏差和不均一位点的出现。该方法得到的结果比基于PCR的WGA方法更加可靠。新型的DNA处理技术可将MDA技术充分利用在FFPE组织样本中高度降解的DNA上。REPLI-g FFPE Kit在位点不变化的同时,实现对珍贵样本材料中DNA的扩增,产物可用于多种下游应用。

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程序

REPLI-g FFPE可使用FFPE组织样本直接进行DNA扩增,无需预先纯化DNA。裂解组织切片后,使用新型缓冲液和酶处理DNA,将片段化的DNA连接起来(参见" REPLI-g FFPE procedure"和" High-molecular-weight ligated DNA")。反应后生成DNA长链,长链经REPLI-g技术扩增。扩增得到的DNA可即用于多数基因分型下游应用,无需进行纯化。

使用REPLI-g FFPE Kit扩增得到的DNA适用于real-time PCR(如使用QuantiFast Kits)和终点式PCR(如使用QIAGEN Fast Cycling PCR Kit)。PCR扩增子应比起始模板的平均片段长度短。还适用于微卫星分析(参见" Reliable microsatellite analysis")和SNP基因分型(REPLI-g FFPE扩增得到的DNA可能不适用于需要限制性内切进行DNA标记的基因分型应用)。

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应用

REPLI-g FFPE扩增的DNA适合以下应用:

  • Real-time PCR
  • 终点式PCR
  • SNP基因分型
  • 微卫星分析 

辅助数据和图表

规格

特点规格
yield10 µg (2h reaction)-40 µg (8h reaction)
qualityassessmentNo
startingmaterialFFPE tissue sections or purified genomic DNA
technologyMDA
maximuminputvolume1 tissue section (10-40 µm thickness)
reactiontime2-8h (2h: standard; 8h: high-yield reaction)
reactionvolume50 µl
startingamountofdna100-300 ng*
applicationsGenotyping, PCR, Real-time PCR
samplesperrunthroughputmedium
amplificationWhole genomic DNA

资源

产品介绍与指南 (4)
Sample to Insight solutions for successful molecular analysis
Second edition — innovative tools
High-quality, nucleic acid purification for successful PCR and NGS experiments.
Critical factors for molecular analysis of FFPE samples
试剂盒操作手册 (1)
For direct whole genome amplification of DNA from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue
安全数据表 (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
快速启动实验方案 (1)
Certificates of Analysis (1)
Safety Data Sheets (2)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
Brochures & Guides (4)
High-quality, nucleic acid purification for successful PCR and NGS experiments.
Second edition — innovative tools
Sample to Insight solutions for successful molecular analysis
Critical factors for molecular analysis of FFPE samples
Kit Handbooks (1)
For direct whole genome amplification of DNA from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue
Additional Resources (1)
Supplementary Protocols (1)
Quick-Start Protocols (1)

文献

Genome-wide DNA methylation analysis of archival formalin-fixed paraffin-embedded tissue using the Illumina Infinium HumanMethylation27 BeadChip.
Thirlwell C; Eymard M; Feber A; Teschendorff A; Pearce K; Lechner M; Widschwendter M; Beck S;
Methods; 2010; 52 (3):248-54 2010 Apr 29 PMID:20434562
Whole genome amplification for array comparative genomic hybridization using DNA extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded histological sections.
Huang J; Pang J; Watanabe T; Ng HK; Ohgaki H;
J Mol Diagn; 2009; 11 (2):109-16 2009 Feb 5 PMID:19197000