QIAcuity Cell and Gene Therapy (CGT) dPCR Assays

QIAcuity Digital PCR System์—์„œ ํƒ์›”ํ•œ ์ •ํ™•๋„, ์žฌํ˜„์„ฑ ๋ฐ ์†๋„์˜ ๋ฒกํ„ฐ ๊ฒŒ๋†ˆ ์ ์ •(titration)์šฉ

S_1234_8_LS_QF_dPCR_CGT_Assay_AMP_restistance_HEX

โœ“ ์—ฐ์ค‘๋ฌดํœด ํ•˜๋ฃจ 24์‹œ๊ฐ„ ์ž๋™ ์˜จ๋ผ์ธ ์ฃผ๋ฌธ ์ฒ˜๋ฆฌ

โœ“ ํ’๋ถ€ํ•œ ์ง€์‹๊ณผ ์ „๋ฌธ์„ฑ์„ ๊ฐ–์ถ˜ ์ œํ’ˆ ๋ฐ ๊ธฐ์ˆ  ์ง€์›

โœ“ ์‹ ์†ํ•˜๊ณ  ์•ˆ์ •์ ์ธ (์žฌ)์ฃผ๋ฌธ

dPCR CGT Assay GFP (FAM)

์นดํƒˆ๋กœ๊ทธ ๋ฒˆํ˜ธ / ID.   250236

500x12ยตl ๋ฐ˜์‘(20x)์šฉ: QIAcuity dPCR ์‹œ์Šคํ…œ๊ณผ ํ•จ๊ป˜ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋Š” GFP์šฉ QIAGEN ์„ธํฌ ๋ฐ ์œ ์ „์ž ์น˜๋ฃŒ ๋ถ„์„.
JPยฅ132,000
๋กœ๊ทธ์ธ ๊ณ„์ • ๊ฐ€๊ฒฉ ๋ณด๊ธฐ.
Assay
GFP
ITR2/5
bGH polyA
WPRE
SV40 promoter
SV40 polyA
CMV promoter
hGH polyA
CMV enhancer
AMP resistance
์—ผ๋ฃŒ
FAM
HEX
Cy5
dPCR CGT Assay GFP (FAM)์€/๋Š” ๋ถ„์ž์ƒ๋ฌผํ•™ ๋ถ„์•ผ์— ์‚ฌ์šฉํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•œ ๊ฒƒ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ์ด ์ œํ’ˆ์€ ์งˆ๋ณ‘์˜ ์ง„๋‹จ, ์˜ˆ๋ฐฉ, ๋˜๋Š” ์น˜๋ฃŒ์šฉ์ด ์•„๋‹™๋‹ˆ๋‹ค.

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ํŠน์ง•

  • ์—ด ๊ฐ€์ง€ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์›จํŠธ ๋žฉ(wet-lab) ๊ฒ€์ฆ์„ ๊ฑฐ์นœ dPCR CGT ๋ถ„์„ ์ œ๊ณต
  • ๋‹ค์–‘ํ•œ ํ˜•๊ด‘๋‹จ(fluorophore) ์„ ํƒ์„ ํ†ตํ•œ ๋ถ„์„ ํ•ญ๋ชฉ๋“ค์€ ๋ฉ€ํ‹ฐํ”Œ๋ ‰์‹ฑ์„ ํ†ตํ•ด ํ•˜๋‚˜์˜ ์ƒ˜ํ”Œ์—์„œ ๋” ๋งŽ์€ ์ •๋ณด ์œ ์ง€
  • qPCR์— ๋ฒ„๊ธˆ๊ฐ€๋Š” ์‰ฝ๊ณ  ๋น ๋ฅธ ์›Œํฌํ”Œ๋กœ์šฐ

์ œํ’ˆ ์„ธ๋ถ€ ์ •๋ณด

์•„๋ฐ๋…ธ ๊ด€๋ จ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค(adeno-associated virus, AAV)๋Š” ์œ ์ „์ž ์น˜๋ฃŒ ์‘์šฉ ๋ถ„์•ผ์—์„œ ๋„๋ฆฌ ์‚ฌ์šฉ๋˜๋Š” ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค ๋ฒกํ„ฐ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ๊ทธ๋Ÿฌ๋‚˜ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค ๋ฒกํ„ฐ์˜ ์ƒ์„ฑ ๋ฐ ์ •์ œ๋Š” ์ž„์ƒ ์—ฐ๊ตฌ ๋˜๋Š” ํ™˜์ž ์น˜๋ฃŒ ์ค‘์— ์•ˆ์ „ํ•˜๊ณ  ์‹ ๋ขฐํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ํˆฌ์—ฌ๋ฅผ ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๊ฒŒ ํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•ด ์—„๊ฒฉํ•œ ํ’ˆ์งˆ ๊ด€๋ฆฌ๊ฐ€ ํ•„์š”ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ๋ฒกํ„ฐ ์—ญ๊ฐ€๋ฅผ ์ •ํ™•ํ•˜๊ฒŒ ์ •๋Ÿ‰ํ™”ํ•˜๊ณ  ์˜ค์—ผ์„ ๊ฒ€์ถœํ•˜๋Š” ๋Šฅ๋ ฅ์€ ์•ˆ์ „ํ•˜๊ณ  ํšจ๊ณผ์ ์ธ ์•„๋ฐ๋…ธ ๊ด€๋ จ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค(adeno-associated virus, AAV) ๊ธฐ๋ฐ˜ ์œ ์ „์ž ์น˜๋ฃŒ์— ๋งค์šฐ ์ค‘์š”ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

์„ฑ๋Šฅ

QIAcuity Cell and Gene Therapy dPCR Assays๋Š” ์—ฌ๋Ÿฌ ํ˜•๊ด‘์œผ๋กœ ์ œ๊ณต๋˜๋Š” ์—ด ๊ฐ€์ง€ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์›จํŠธ ๋žฉ(wet-lab) ๊ฒ€์ฆ์„ ๊ฑฐ์นœ dPCR CGT ๋ถ„์„์œผ๋กœ, ๋ฉ€ํ‹ฐํ”Œ๋ ‰์Šค ์„ค์ •์—์„œ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค ์—ญ๊ฐ€๋ฅผ ์‹ ์†ํ•˜๊ฒŒ ์ธก์ •ํ•˜๋Š” ๋ฐ ์žˆ์–ด ๋›ฐ์–ด๋‚œ ์ •ํ™•๋„, ์žฌํ˜„์„ฑ ๋ฐ ์ตœ์†Œ 4์ž๋ฆฟ ์ˆ˜ ์ด์ƒ์˜ ๋™์  ๋ฒ”์œ„๋ฅผ ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๊ฒŒ ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ด ๋ถ„์„์€ QIAcuity Digital PCR System, QIAcuity Probe PCR Kit ๋ฐ QIAcuity Nanoplate์™€ ํ•จ๊ป˜ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉฐ, end-to-end dPCR ์›Œํฌํ”Œ๋กœ์šฐ๋Š” qPCR ์‹คํ—˜๊ณผ ๋น„์Šทํ•˜์ง€๋งŒ ๊ฒฐ๊ณผ ๊ฐ’์€ ์ƒ˜ํ”Œ๋‚ด์˜ ์•„๋ฐ๋…ธ ๊ด€๋ จ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค(adeno-associated virus, AAV) ๋ฒกํ„ฐ ๊ฒŒ๋†ˆ ๋ณต์‚ฌ๋ณธ์˜ ์ ˆ๋Œ€ ์ •๋Ÿ‰ ๊ฐ’์„ ์ œ๊ณตํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ๋ถ„์„์€ ๋ฐ”์ด์˜ค์ œ์•ฝ ์ œ์กฐ ๋ฐ QC ์š”๊ตฌ ์‚ฌํ•ญ์„ ์—ผ๋‘์— ๋‘๊ณ  ์„ค๊ณ„๋˜์—ˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

์›๋ฆฌ

๋‚˜๋…ธํ”Œ๋ ˆ์ดํŠธ์—์„œ์˜ dPCR ๋ฐ˜์‘ ์›๋ฆฌ๋Š” ์—ฌ๊ธฐ์— ์„ค๋ช…๋˜์–ด ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

์ „์šฉ CGT assay๋ฅผ ์ด์šฉํ•˜์—ฌ QIAcuity์—์„œ ์•„๋ฐ๋…ธ ๊ด€๋ จ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค(adeno-associated virus, AAV)์ •๋Ÿ‰์ด ๊ฐ€๋Šฅํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ด๋Ÿฌํ•œ ๋ถ„์„ ํ•ญ๋ชฉ(assay)๋“ค์€ ๊ฒ€์ฆ๋œ ํ•ญ๋ชฉ๋“ค๋กœ ์‹ฑ๊ธ€ํ”Œ๋ ‰์Šค ๋ฐ ๋ฉ€ํ‹ฐํ”Œ๋ ‰์Šค ๋ฐ˜์‘์— ์‚ฌ์šฉํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์œผ๋ฉฐ  ๊ด€์‹ฌ ์œ ์ „์ž assay๋“ค๊ณผ ๊ฒฐํ•ฉ ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๋ฉฐ, ๋‹ค์Œ๊ณผ ๊ฐ™์€ ํŠน์„ฑ์„ ์ œ๊ณตํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • 0.3 copies/ยตl๊นŒ์ง€ ์ •ํ™•ํ•œ ์ •๋Ÿ‰ํ™”
  • ๋„“์€ ๋™์  ๋ฒ”์œ„(dynamic range)์— ๊ฑธ์นœ ๊ณ ์ •๋ฐ€๋„
  • ๋ถ„์„ ํ•ญ๋ชฉ(ํ˜•๊ด‘๊ณผ ๋ฌด๊ด€) ๋ฐ ์‹คํ—˜์ž ์ „๋ฐ˜์— ๊ฑธ์ณ ๋†’์€ ์ •ํ™•๋„
  • ํ˜•๊ด‘ ๋ฐ ์‹คํ—˜์ž์™€ ๋ฌด๊ด€ํ•œ ๋†’์€ ์ •๋ฐ€๋„(ํ‰๊ท ์—์„œ <10% ํŽธ์ฐจ)
  • dPCR ๋ฐ qPCR ํŒ๋…๊ฐ’๊ณผ์˜ ํ˜ธํ™˜์„ฑ

์ ˆ์ฐจ

QIAcuity Cell and Gene Therapy dPCR Assays๋Š” ์ฆ‰์‹œ ์‚ฌ์šฉ ๊ฐ€๋Šฅํ•œ 20x ํ”„๋ผ์ด๋จธ-ํ”„๋กœ๋ธŒ ํ˜ผํ•ฉ๋ฌผ๋กœ ์ œ๊ณต๋˜๊ณ  ์—ฌ๋Ÿฌ ํ˜•๊ด‘๋‹จ(fluorophore) ์„ ํƒ์ด ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๋ฉฐ QIAcuity Probe PCR Kit์™€ ํ•จ๊ป˜ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋Š” ๋ฐ์— ์ตœ์ ํ™”๋˜์–ด ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ์ด๋Ÿฌํ•œ ํ•ญ๋ชฉ๋“ค์€ ๋ฒกํ„ฐ ์—ญ๊ฐ€์˜ ์ ˆ๋Œ€ ์ •๋Ÿ‰๊ณผ ๋ถ„์„์˜ ๊ฒฌ๊ณ ์„ฑ์„ ๊ฐ€์ง€๋Š” ์‹ฑ๊ธ€ํ”Œ๋ ‰์Šค ๋ฐ ๋ฉ€ํ‹ฐํ”Œ๋ ‰์Šค CGT ์• ํ”Œ๋ฆฌ์ผ€์ด์…˜์„ ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๊ฒŒ ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

์‘์šฉ ๋ถ„์•ผ

QIAcuity Cell and Gene Therapy (CGT) dPCR Assays๋Š” ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค ๋ฒกํ„ฐ ์—ญ๊ฐ€ ์ธก์ •, ๋ฒกํ„ฐ ๊ฒŒ๋†ˆ ๋ฌด๊ฒฐ์„ฑ ์ธก์ • ๋ฐ ์•„๋ฐ๋…ธ ๊ด€๋ จ ๋ฐ”์ด๋Ÿฌ์Šค(adeno-associated virus, AAV) ์ƒ์‚ฐ์— AMP ํ”Œ๋ผ์Šค๋ฏธ๋“œ๋ฅผ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋Š” ๊ฒฝ์šฐ ์ž ์žฌ์ ์ธ ํ”Œ๋ผ์Šค๋ฏธ๋“œ ์˜ค์—ผ ๊ฒฐ์ •์„ ๋น„๋กฏํ•œ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์‘์šฉ ๋ถ„์•ผ์— ์‚ฌ์šฉ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ด๋Ÿฌํ•œ dPCR CGT Assays๋ฅผ ์œ ์ „์ž ์น˜๋ฃŒ ๊ฐœ๋ฐœ์˜ ํ’ˆ์งˆ ๊ด€๋ฆฌ ํ”„๋กœ์„ธ์Šค์— ํ†ตํ•ฉํ•˜๋ฉด ์•ˆ์ „ํ•˜๊ณ  ๊ฐ•๋ ฅํ•œ ์น˜๋ฃŒ์ œ๋ฅผ ๋”์šฑ ํ™•์‹คํ•˜๊ฒŒ ์ƒ์‚ฐํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

์ง€์›๋˜๋Š” ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ฐ ์ˆ˜์น˜