qBiomarker Copy Number PCR Arrays

用于分析拷贝数变化和改变

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qBiomarker Copy Number PCR Arrays

目录编号 / ID.   337802

Panels of copy number assays in 96-well, 384-well, or Rotor-Disc formats
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qBiomarker Copy Number PCR Arrays 旨在用于分子生物学应用。这些产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。
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特点

  • 在real-time PCR仪上进行拷贝数分析
  • 经湿法验证
  • 整合的多拷贝对照,用于标准化
  • 免费的即用型数据分析工具

产品详情

qBiomarker Copy Number PCR Arrays用于检测一组信号通路或疾病相关的基因组位点的拷贝数。芯片可检测生殖细胞(拷贝数变化或CNV)或获得性(拷贝数改变或CNA)的拷贝数变化。基因组位点是根据临床或功能相关性及发生频率,从全面的数据库和文献中挑选。

绩效

使用real-time PCR在DNA样本中进行拷贝数变化检测时,两个因素很关键:real-time PCR分析的表现和对DNA起始量的可靠标准化。在qBiomarker Copy Number PCR Array上的每个qBiomarker Copy Number PCR Assay都经湿法验证,有几个因素影响real-time PCR结果的准确性:特异性、宽动态范围和统一的高扩增效率。分析质量的实验室验证确保qBiomarker Copy Number PCR Assays获得可靠结果。

qBiomarker Copy Number PCR Assays可准确鉴定细胞学方法发现含有染色体畸变的细胞系中的非整倍体。检测X染色体上的 AR MECP2,可准备定量含有1、2、3、4拷贝X染色体细胞系的基因拷贝数。

qBiomarker Copy Number PCR Arrays使用qBiomarker Multicopy Reference Copy Number PCR Assay (MRef)对DNA起始量进行优良的标准化。单拷贝参照基因(如RNase P)在癌细胞系中会产生 不可靠的标准化。相比起来,MRef分析可提供 准确的标准化,产生更可靠地结果。总之,对芯片上的每个qBiomarker Copy Number PCR Assay的实验室验证,以及MRef分析提供的优良的DNA起始量标准化,可确保准确、可靠地结果。

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原理

每个qBiomarker Copy Number PCR Array含有一组qBiomarker Copy Number PCR Assays,分析一套严格筛选的的通路或疾病相关的GOIs或ROIs。每次分析都重复四次,以提高统计分析时拷贝数结果的准确性。芯片有96孔板、384孔板和Rotor-Disc规格。 96孔板芯片 Rotor-Disc芯片各含有一个样本24个基因(23个靶基因和MRef)的4次重复,或是一个样本96个基因(95个靶基因和MRef)的4次重复。

所有qBiomarker Copy Number PCR Assays都设计在基因组的独特区域。每个芯片都含有一个多拷贝参照分析,即qBiomarker Multicopy Reference Copy Number PCR Assay (MRef)。参照分析检测人体基因组中出现超过40次的稳定序列,其拷贝数不会受自身基因组变化影响或影响很小。检测包含参照分析可运用ΔΔCT法对特定靶标进行准确的拷贝数分析或相对拷贝数变化分析。

qBiomarker Copy Number PCR Array的规格和 操作流程的简便性使常规的拷贝数分析可在任何有real-time PCR仪的实验室进行。

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程序

完成qBiomarker Copy Number PCR Array 操作流程的第一步是从新鲜或冷冻样本中分离基因组DNA,或是从福尔马林固定石蜡包埋切片中提取DNA(推荐使用QIAGEN QIAamp DNA Mini Kit或FFPE Tissue Kit)。如果DNA样本量很少,从新鲜或冷冻组织中提取的DNA可使用QIAGEN REPLI-g UltraFast Kit统一扩增。将DNA与合适的qBiomarker SYBR® Green Mastermix混合后,等体积加入到同一qBiomarker Copy Number PCR Array孔板的每个孔中,孔板含有预分配的位点特异性引物分析。使用real-time PCR确定特定样本的拷贝数状态,使用ΔΔCT法将检测样本与参照基因组对比进行分析。在芯片体系构建之前可选择性进行DNA样本质量控制步骤。
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应用

qBiomarker Copy Number PCR Arrays非常适合准确分析一套通路或疾病相关基因的拷贝数改变或变化。

辅助数据和图表

资源

安全数据表 (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
仪器技术参数 (2)
For gene expression and genomic analysis
For profiling copy number variation and alterations
试剂盒操作手册 (1)
For real-time PCR-based, copy number alteration and variation analysis
Certificates of Analysis (1)