RT2 Profiler PCR Arrays

信頼性と感度の高い遺伝子発現プロファイリング

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RT2 Profiler PCR Array

カタログ番号 / ID.   330231

RT2 Profiler PCR Array
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Product
RT2 Profiler PCR Array
RT2 RNA QC PCR Array
RT2 Profiler PCR Arraysは分子生物学的アプリケーション用であり、疾病の診断、予防、あるいは治療に使用することはできません。
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特徴

  • 遺伝子パネルの発現をプロファイル
  • 簡単なリアルタイムPCR法で高い感度
  • プレアンプ使用で、わずか1 ngのトータルRNAで使用可能
  • 一般的なリアルタイムPCR装置を使用可能
  • 無料のオンラインツールを用いて簡単なデータ解析

製品詳細

RT2 Profiler PCR Arrayは、パスウェイあるいは疾病に特異的な遺伝子に焦点をあてたリアルタイムPCRプライマーアッセイセット(至適化済み)で、 適切なRNA品質コントロールも含まれており、96ウェルプレート、384ウェルプレート、100-well discフォーマットでお届けします。RT2 Profiler PCR Arraysは、リアルタイムPCRの感度と、複数の遺伝子のプロファイリングが可能なマイクロアレイの特長を持ち合わせた遺伝子発現解析を実現します。

パフォーマンス

感度

RT2 First Strand Kitの感度により、アレイプレートあたりわずか1 ngまたは最高5 µgのトータルRNAで80%を超えるpresent call rateが得られます(図“ わずか25 ngのRNAでポジティブな結果”)。

再現性

PCRアレイトータルシステムは、技術的なreplicate実験、異なるロット間、異なる装置間で高い相関性(相関係数が0.99を超える)をもつことが証明され、生体サンプルの発現の差を高い信頼性で検出できます(図“ 異なるユーザー間で高い再現性”)。

特異性

高品質のスタートRNAを用いたPCRアレイシステムでは、プライマーダイマーや二次産物がなく、予想されたサイズの単一バンドが得られるため、高精度なリアルタイムPCR 結果を実現します(図“ すべての反応で単一の遺伝子特異的産物”)。

一定したPCR増幅効率

全遺伝子および全サンプルを通じて遺伝子発現レベルの正確な比較を行なうためには、一定したPCR増幅効率がPCRアレイテクノロジーに必須です。当社独自のプライマー設計アルゴリズムと、全プライマーアッセイの厳密なテストにより、PCRアレイでの全プライマーアッセイの高いパフォーマンスを保証します(図“ PCRアレイは高精度な結果を実現”)。

図参照

原理

RT2 Profiler PCR Arrayは、フォーカスした遺伝子パネルの発現解析のための信頼できるツールです。各96ウエルプレート、384ウエルプレート、100-well disc PCR Arrayは、徹底的に研究されたパスウエイや疾病に関連した遺伝子パネル用のプライマーアッセイ(SYBR® Greenに至適化済み)を提供します。RT2 Profiler PCR Arrayはまたお客様の研究目的に即した遺伝子パネルをご提供するためにカスタマイズも可能です。高品質なプライマー設計とRT2 SYBR® Green qPCR Mastermix成分により、PCR アレイは同一サイクリング条件下で、96あるいは384種類の遺伝子特異的産物の同時増幅を実現します。

この組み合わせにより、RT2 Profiler PCR Arrayで正確なリアルタイムSYBR® Green結果に必要な高い感度と増幅効率が得られます。PCRアレイはどのような研究室でも容易に使用できます。

RT2 Profiler PCR Arrayは通常のサンプル(0.1~5 µgのRNA)、 FFPEサンプル、少量のサンプル(1~100 ngのRNA)から調製したRNAを使用して十分な感度を発揮できます。

操作手順

cDNAテンプレートと適切で即使用可能なPCRマスターミックスを混和し、同一プレートの各ウエルに等量分注し、リアルタイムPCRサイクリングプリグラムを起動します(フローチャート“ 簡単な操作”)。RT2 Profiler PCR Arrayは、QIAGEN、ABI、Bio-Rad、Eppendorf、Roche、Stratageneの装置で使用可能です。

適応性が高いレイアウトとコントロール

RT2 Profiler PCR Arrayは96ウエルプレート、384ウエルプレート、100-well discフォーマットで入手可能で、84あるいは370種類の疾病あるいはパスウエイに関連する遺伝子と5種類のハウスキーピング遺伝子の発現を調べることができます。RT2 Profiler PCR Arrayには以下の目的のためにコントロールが入っています:

  • データの標準化  
  • ゲノムDNAのコンタミを検出
  • RNAサンプル品質 
  • 一般的なPCRパフォーマンス
使いやすいデータ解析

エクセルベースのデータ解析テンプレートあるいはウエブベースのソフトウェアを用いてデータ解析を簡単に行なえます。データ解析はΔΔCT法に基づき、ハウスキーピング遺伝子に対して生データを標準化します。

図参照

アプリケーション

RT2 PCR Profiler Arrayは次のような生物および医学研究領域で使用できます。

  • がん
  • 炎症およびサイトカインのプロファイリング
  • 幹細胞
  • 神経化学
  • シグナル伝達パスウェイ
  • 細胞接着と細胞移動
  • バイオマーカーのスクリーニングと検証

裏付けデータと数値

リソース

パンフレット (5)
MSDS (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
ダウンロードファイル (3)
For analyzing gene expression data from RT2 Profiler PCR Arrays 
Data analysis file for RT² Profiler PCR Array Housekeeping Genes
Catalog number- 330231
Pathway number- PAXX-000
RNA QC Data Analysis
XLS (484KB)

Data analysis file for RT² ProfilerRT² Profiler™ PCR Array RT2 RNA QC
Catalog number- 330231
Pathway number- PAXX-999

サイエンティフィック・ポスター (1)
Poster for download
キットハンドブック (1)
For pathway-focused gene expression profiling using real-time RT-PCR
機器テクニカル資料 (2)
For gene expression and genomic analysis
For pathway-focused gene expression analysis
Certificates of Analysis (1)

出版物

CD8 T cells use IFN-γ to protect against the lethal effects of a respiratory poxvirus infection.
Goulding J; Abboud G; Tahiliani V; Desai P; Hutchinson TE; Salek-Ardakani S;
J Immunol; 2014; 192 (11):5415-25 2014 Apr 18 PMID:24748494
Sphingosine kinase 1 expressed by endothelial colony-forming cells has a critical role in their revascularization activity.
Poitevin S; Cussac D; Leroyer AS; Albinet V; Sarlon-Bartoli G; Guillet B; Hubert L; Andrieu-Abadie N; Couderc B; Parini A; Dignat-George F; Sabatier F;
Cardiovasc Res; 2014; 103 (1):121-30 2014 Apr 17 PMID:24743591
Adipose tissue insulin resistance due to loss of PI3K p110α leads to decreased energy expenditure and obesity.
Nelson VL; Jiang YP; Dickman KG; Ballou LM; Lin RZ;
Am J Physiol Endocrinol Metab; 2014; 306 (10):E1205-16 2014 Apr 1 PMID:24691033
FBXW7 mutations in melanoma and a new therapeutic paradigm.
Aydin IT; Melamed RD; Adams SJ; Castillo-Martin M; Demir A; Bryk D; Brunner G; Cordon-Cardo C; Osman I; Rabadan R; Celebi JT;
J Natl Cancer Inst; 2014; 106 (6):dju107 2014 May 16 PMID:24838835
β-Carotene-9',10'-oxygenase status modulates the impact of dietary tomato and lycopene on hepatic nuclear receptor-, stress-, and metabolism-related gene expression in mice.
Tan HL; Moran NE; Cichon MJ; Riedl KM; Schwartz SJ; Erdman JW Jr; Pearl DK; Thomas-Ahner JM; Clinton SK;
J Nutr; 2014; 144 (4):431-9 2014 Feb 19 PMID:24553694